Bitki bilimleri ve teknolojileri (bitki genetiği ve ıslahı, bitki moleküler biyolojisi ve genetiği, bitki genetik mühendisliği, bitki biyokimyası ve metabolomiği, bitki proteomiği, bitki fizyolojisi, ekonomik ve farmasötik önemi olan bitki kimyasalları) alanlarında temel ve uygulamalı bilimsel araştırmalar yapmak, ve bu araştırmalar ile birlikte yüksek verim ve kalite özelliklerine sahip, biyotik ve abiyotik streslere dayanım özellikleri kazandırılmış, ülkemiz için ekonomik ve stratejik öneme sahip sebze, meyve ve tarla bitkilerinde yeni çeşitlerin geliştirilmesini sağlamak amaçlarımız arasındadır. Ayrıca, ekonomik önemi yüksek beslenme ve sağlıkla ilişkili kimyasalları yüksek miktarlarda sentezleyen bitki çeşitlerini geliştirmek; sebze, meyve ve tarla bitkileri türlerinde tohumluk olarak üretilen ebeveynlerde ve çeşitlerinde ismine doğruluk testlerinin moleküler yöntemlerle gerçekleştirmek de diğer amaçlarımız arasında yer almaktadır.
BITEK merkez olarak, sebzeler, meyveler, tahıllar, baklagiller, endüstriyel bitkiler, süs bitkileri, tıbbi ve aromatik bitkiler, ormancılık ve ekolojik denge korunumu için gerekli bitkilerde yüksek verim ve kalite özellikleri bulunan materyallerin seleksiyonu, fenotipik özelliklerinin belirlenmesi ve genetik çeşitliliklerinin tespit edilmesi ve populasyon yapılarının ortaya çıkarılması ve çekirdek koleksiyonların oluşturulmasını sağlamak, ve bununla birlikte değişik bitki kökenli bioaktif moleküllerin belirlenmesi, izolasyonu, biyolojik aktivitelerinin karakterizasyonu ve topikal ilaç formülasyonlarının geliştirmek de hedeflerimiz arasında bulunmaktadır.